Separation of DNA fragments in DGGE

Separation of DNA fragments in DGGE and TGGE is based on the decreased electrophoretic mobility of partially melted double-stranded DNA molecules in polyacrylamide gels containing a linear gradient of DNA denaturants (a mix- ture of urea and formamide) or a linear temperature gradient, which is created by two water baths attached to a c o o l i n g p l a t e u n d e r t h e g e l . ~Iolecules w i t h d i f f e r e n t sequences may have a different melting behavior, and will, therefore, stop migrating at different positions in the gel (for a more detailed description see Muyzer and Smalla [6°°]).
Since the first publication by Muyzer elof [7J in 1993 an incrcasing number of studies in microbial ecology have used DGGE/TGGE. In this review I describe the recent developments of these techniques and discuss why they are so important for ecological studies.

Results (Thai) 1:

แยกชิ้นส่วนดีเอ็นเอใน DGGE และ TGGE ตามเคลื่อนที่ด้วยการลดบางส่วนหลอมควั่นคู่ดีเอ็นเอโมเลกุลใน polyacrylamide gels ประกอบด้วยการไล่ระดับสีเส้นของ DNA denaturants (การผสม-ture urea และ formamide) หรือเชิงเส้นอุณหภูมิไล่ระดับสี ซึ่งสร้างขึ้น โดยสองน้ำอาบน้ำกับตัว c o o l ฉัน n g p l t e u n d e r t h e g e l ~ Iolecules w ผม t h d ฉัน f f e r e n t ลำดับอาจมีพฤติกรรมการละลายที่แตกต่าง และจะ ดังนั้น หยุดย้ายที่ตำแหน่งต่าง ๆ ในเจ (สำหรับคำอธิบายรายละเอียดเพิ่มเติมดู Muyzer และ Smalla [6° °])นับตั้งแต่ตีพิมพ์ครั้งแรกโดย Muyzer elof [7J 1993 หมายเลข incrcasing ศึกษาในนิเวศวิทยาจุลินทรีย์ได้ใช้ DGGE/TGGE ในบทความนี้ ผมอธิบายการพัฒนาล่าสุดของเทคนิคเหล่านี้ และอธิบายว่าทำไมพวกเขาจะสำคัญเพื่อศึกษาระบบนิเวศ

Results (Thai) 2:

แยกชิ้นส่วนดีเอ็นเอใน DGGE และ TGGE จะขึ้นอยู่กับการเคลื่อนไหวที่ลดลงของอิเลคละลายบางส่วนเกลียวคู่ดีเอ็นเอโมเลกุลในเจลอะคริเลตที่มีความลาดชันเชิงเส้นของ denaturants ดีเอ็นเอ (ก ture mix- ยูเรียและไมด์) หรืออุณหภูมิลาดเชิงเส้นซึ่ง ถูกสร้างขึ้นโดยสองห้องอาบน้ำที่แนบมากับน้ำเจล acoolingplateunderthe ~ Iolecules ลำดับ withdifferent อาจจะมีการละลายพฤติกรรมที่แตกต่างกันและจะจึงหยุดการโยกย้ายตำแหน่งที่แตกต่างกันในเจล (สำหรับรายละเอียดเพิ่มเติมโปรดดู Muyzer และ Smalla [6 °°]).
ตั้งแต่ตีพิมพ์ครั้งแรกโดย Muyzer elof [7J ในปี 1993 จำนวน incrcasing ของการศึกษาในระบบนิเวศของจุลินทรีย์ได้ใช้ DGGE / TGGE ในการทบทวนนี้ฉันอธิบายการพัฒนาล่าสุดของเทคนิคเหล่านี้และหารือว่าทำไมพวกเขาจึงเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการศึกษาระบบนิเวศ