Under the Refine tab, change the RM

Under the Refine tab, change the RMSD convergence criterion to 0.5 in order to save some time, and hit Minimize..., then Start to minimize the structure. Notice that we are carrying out minimization in the presence of bound ligand in order to avoid side chains moving into the cavity to which we hope to dock our molecules. The minimization will take nearly 10 minutes.

Results (Vietnamese) 1:

Trong tab Tinh chỉnh, thay đổi tiêu chí hội tụ RMSD thành 0,5 để tiết kiệm thời gian và nhấn Thu nhỏ..., sau đó Bắt đầu để thu nhỏ cấu trúc. Lưu ý rằng chúng tôi đang tiến hành giảm thiểu sự có mặt của phối tử bị ràng buộc để tránh các chuỗi bên di chuyển vào khoang mà chúng tôi hy vọng sẽ gắn các phân tử của mình vào đó. Việc giảm thiểu sẽ mất gần 10 phút.

Results (Vietnamese) 2:

Trong tab Optimization, thay đổi tiêu chuẩn hội tụ RMSD thành 0,5 để tiết kiệm thời gian và nhấn Minimize... Sau đó bắt đầu giảm thiểu cấu trúc. Lưu ý rằng chúng tôi giảm thiểu sự hiện diện của các phối tử liên kết để tránh các chuỗi bên đi vào khoang mà chúng tôi muốn gắn các phân tử. Việc giảm thiểu sẽ mất gần 10 phút.

Results (Vietnamese) 3:

Dưới tab Optimize, thay đổi tiêu chuẩn convergence RMSD thành 0.5 để tiết kiệm thời gian, sau đó bấm vào Minimize..., và sau đó bắt đầu thu nhỏ cấu trúc. Xin lưu ý rằng chúng tôi đã giảm thiểu sự hiện diện của các ligand kết hợp để tránh các chuỗi bên di chuyển vào các lỗ mà chúng tôi muốn các phân tử dừng lại. Phải mất gần 10 phút để giảm thiểu.