To investigate the genetic changes

To investigate the genetic changes associated with AML relapse, and to determine whether clonal evolution contributes to relapse, we performed whole-genome sequencing of primary tumour–relapse pairs and matched skin samples from eight patients, including unique patient identifier (UPN) 933124, whose primary tumour mutations were previously reported3. Informed consent explicit for whole-genome sequencing was obtained for all patients on a protocol approved by the Washington University Medical School Institutional Review Board. We obtained >25× haploid coverage and >97% diploid coverage for each sample (Supplementary Table 1 and Supplementary Information). These patients were from five different French–American–British haematological subtypes, with elapsed times of 235–961 days between initial diagnosis and relapse (Supplementary Table 2a, b).

Candidate somatic events in the primary tumour and relapse genomes were identified4, 5 and selected for hybridization capture-based validation using methods described in Supplementary Information. Deep sequencing of the captured target DNAs from skin (the matched normal tissue), primary tumour and relapse tumour specimens6 (Supplementary Table 3) yielded a median of 590-fold coverage per site. The average number of mutations and structural variants was 539 (range 118–1,292) per case (Fig. 1a).

Results (Thai) 1:

การตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับการกลับไปเสพภาษา และกำหนดว่า วิวัฒนาการ clonal สนับสนุนการกลับไปเสพ เราทำทั้งจีโนมลำดับคู่หลักเนื้องอก – การกลับไปเสพและตัวอย่างผิวหนังตรงกันจากผู้ป่วยแปด รวมรหัสผู้ป่วยเฉพาะ (UPN) 933124 กลายพันธุ์ที่มีเนื้องอกหลักเคย reported3 แจ้งความยินยอมอย่างชัดเจนสำหรับทั้งจีโนมลำดับที่รับผู้ป่วยทั้งหมดบนโพรโทคอลวอชิงตันมหาวิทยาลัยแพทย์โรงเรียนสถาบันทบทวนคณะกรรมการธนาคาร เรารับ > 25 × haploid ความครอบคลุม และ > 97% ครอบคลุม diploid สำหรับแต่ละตัวอย่าง (ตารางที่ 1 ส่งเสริมการขายและรายละเอียดเพิ่มเติม) ผู้ป่วยเหล่านี้ได้จากห้าต่างฝรั่งเศสอเมริกันอังกฤษ haematological subtypes เวลาผ่านไป 235 – 961 วันระหว่างวินิจฉัยเบื้องต้นและการกลับไปเสพ (ตารางเสริม 2a, b)เหตุการณ์ somatic ผู้สมัครในหลักเนื้องอกและการกลับไปเสพ genomes identified4, 5 และเลือกการ hybridization ตามจับตรวจสอบโดยใช้วิธีอธิบายในรายละเอียดเพิ่มเติมได้ ลึกลำดับเบสเป้าหมายจับ DNAs จากผิว (จับคู่ปกติเนื้อเยื่อ), เนื้องอกหลัก และกลับไปเสพเนื้องอก specimens6 (เสริมตาราง 3) หาค่ามัธยฐานของความครอบคลุม 590-fold ต่อไซต์ จำนวนเฉลี่ยของการกลายพันธุ์และโครงสร้างย่อย 539 (ช่วง 118 – 1,292) สำหรับแต่ละกรณี (Fig. 1a)

Results (Thai) 2:

ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับการกำเริบของโรค AML และเพื่อตรวจสอบว่าวิวัฒนาการ clonal ก่อให้เกิดการกำเริบของโรคเราดำเนินการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของคู่มะเร็งกำเริบหลักและจับคู่ตัวอย่างผิวจากแปดผู้ป่วยรวมทั้งระบุผู้ป่วยที่ไม่ซ้ำกัน (UPN) 933124 ซึ่ง การกลายพันธุ์เนื้องอกหลักก่อนหน้านี้ reported3 ความยินยอมอย่างชัดเจนสำหรับการหาลำดับจีโนมทั้งหมดที่ได้รับสำหรับผู้ป่วยทั้งหมดที่อยู่บนโปรโตคอลรับการอนุมัติจากมหาวิทยาลัยวอชิงตันโรงเรียนแพทย์คณะกรรมการตรวจสอบสถาบัน เราได้รับ> 25 ×คุ้มครองเดี่ยวและ> 97% คุ้มครองซ้ำสำหรับแต่ละตัวอย่าง (เสริมตารางที่ 1 และข้อมูลเพิ่มเติม) ผู้ป่วยเหล่านี้มาจากที่แตกต่างกันห้าฝรั่งเศสอเมริกันอังกฤษเชื้อเลือดกับเวลาที่ผ่านไปของ 235-961 วันระหว่างการวินิจฉัยเบื้องต้นและการกำเริบของโรค (ตารางเสริม 2a, ข). ผู้สมัครเหตุการณ์ร่างกายในเนื้องอกหลักและจีโนมของการกำเริบของโรคเป็น identified4 5 และ เลือกสำหรับการตรวจสอบการผสมพันธุ์จับภาพโดยใช้วิธีการที่อธิบายไว้ในข้อมูลเพิ่มเติม ลำดับลึกของดีเอ็นเอที่ถูกจับจากผิวหนัง (เนื้อเยื่อปกติจับคู่), เนื้องอกหลักและเนื้องอกกำเริบ specimens6 (เสริมตารางที่ 3) ส่งผลให้ค่าเฉลี่ยของความคุ้มครอง 590 เท่าต่อเว็บไซต์ จำนวนเฉลี่ยของการกลายพันธุ์และสายพันธุ์ที่มีโครงสร้างเป็น 539 (ช่วง 118-1,292) ต่อกรณี (รูป. 1a)

Results (Thai) 3:

เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับ AML กำเริบ และเพื่อตรวจสอบว่าวิวัฒนาการงานก่อให้กำเริบ เราดำเนินการทั้งจีโนมลำดับของการงอกและคู่และคู่ตัวอย่างผิวหนังกำเริบจากแปดผู้ป่วย รวมทั้งระบุเอกลักษณ์ ( UPN ) 933124 ผู้ป่วยที่มีเนื้องอกปฐมภูมิการกลายพันธุ์ก่อนหน้านี้ reported3 .ความยินยอมที่ชัดเจนสำหรับทั้งจีโนมลำดับได้ ผู้ป่วยทั้งหมดในขั้นตอนการอนุมัติโดยโรงเรียนแพทย์มหาวิทยาลัยวอชิงตันสถาบันทบทวนบอร์ด เราได้รับความคุ้มครองและ > > 25 ×โครโมโซม 97% ครอบคลุมซ้ำสำหรับแต่ละตัวอย่าง ( ตารางประกอบ 1 และข้อมูลเพิ่มเติม )ผู้ป่วยเหล่านี้จากฝรั่งเศสและอังกฤษและอเมริกัน ห้าที่แตกต่างกันก่อนชนิดย่อยที่มีผ่านไปครั้งที่ 235 ( 961  วันระหว่างการวินิจฉัยเบื้องต้นและกำเริบ ( เสริมโต๊ะ 2A , B )

ผู้สมัครโซมาเหตุการณ์ในเนื้องอกปฐมภูมิและ relapse จีโนมเป็น identified4 5 และเลือกสำหรับการตรวจสอบการใช้สารจับวิธีการอธิบายไว้ในข้อมูลเพิ่มเติม ตามลำดับลึกของจับเป้าหมายจำเพาะจากผิว ( แบบปกติเนื้อเยื่อ ) , เนื้องอกปฐมภูมิ และการกำเริบของโรคเนื้องอก specimens6 ( ตารางเพิ่มเติม 3 ) พบว่าค่าเฉลี่ยของ 590 พับครอบคลุมต่อเว็บไซต์ จำนวนเฉลี่ยของการกลายพันธุ์และตัวแปรโครงสร้าง 539 ( ช่วง 118 – 1351 ) ต่อราย ( รูปที่ 1A )