JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, J

JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, June 2003, p. 2348–2357 Vol. 41, No. 6
0095-1137/03/$08.00 0 DOI: 10.1128/JCM.41.6.2348–2357.2003
Copyright © 2003, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.
The Genus Aeromonas: Biochemical Characteristics, Atypical
Reactions, and Phenotypic Identification Schemes
Sharon L. Abbott, Wendy K. W. Cheung, and J. Michael Janda*
Microbial Diseases Laboratory, Division of Communicable Disease Control, California Department of
Health Services, Richmond, California 94804
Received 2 December 2002/Returned for modification 4 February 2003/Accepted 25 February 2003
A total of 193 strains representing 14 different Aeromonas genomospecies were evaluated for 63 phenotypic
properties to create useful tables for the reference identification of mesophilic aeromonads. Only 9 of 62
biochemical tests (14%) yielded uniform results, and the fermentation of certain carbohydrates was found to
be linked to specific species. A number of unusual or aberrant properties for the genus Aeromonas were also
detected in the collection of 428 strains (193 in the phenotypic study, 235 in a retrospective review). These tests
included susceptibility to the vibriostatic agent, fermentation of m-inositol and D-xylose, hydrolysis of urea, and
the lack of cytochrome oxidase activity. Fermentation of melibiose was linked to raffinose fermentation in all
Aeromonas species except A. jandaei. Keys are provided for clinical laboratories choosing to identify aeromonads
to species level based upon initial Møeller decarboxylase and dihydrolase reactions. In addition,
several new tests were identified that help to separate members of the A. caviae complex (A. caviae, A. media,
and A. eucreonophila).
The genus Aeromonas has undergone a number of taxonomic
and nomenclature revisions over the past 15 years. Although
originally placed in the family Vibrionaceae (34), which
also included the genera Vibrio, Photobacterium, and Plesiomonas,
subsequent phylogenetic investigations indicated that the
genus Aeromonas is not closely related to vibrios but rather
forms a monophyletic unit in the -3 subgroup of the class
Proteobacteria (25, 31). These conclusions necessitated the removal
of Aeromonas from the family Vibrionaceae and transfer
to a new family, the Aeromonadaceae (8). Similarly, only five
species of Aeromonas were recognized 15 years ago (21), three
of which (A. hydrophila, A. sobria, and A. caviae) existed as
phenospecies, that is, a named species containing multiple
DNA groups, the members of which could not be distinguished
from one another by simple biochemical characteristics. Subsequent
systematic investigations have resulted in the number
of valid published genomospecies rising to 14 (23), and it is
anticipated that additional species will be described because
rare strains have been identified that do not reside in any
established Aeromonas species.
The genus Aeromonas comprises important human pathogens
causing primary and secondary septicemia in immunocompromised
persons, serious wound infections in healthy individuals
and in patients undergoing medicinal leech therapy,
and a number of less well described illnesses such as peritonitis,
meningitis, and infections of the eye, joints, and bones (18).
Gastroenteritis, the most common clinical manifestation, remains
controversial (18). While there are a number of welldescribed
cases of Aeromonas-associated gastroenteritis in the
literature, it still remains unproven whether most fecal isolates
recovered from symptomatic persons are the etiologic agent
responsible for the diarrheal syndrome. One theory to explain
this contradiction is that only specific subsets of Aeromonas are
pathogenic for humans and that biotyping schemes need to be
developed to differentiate environmental from clinical strains
(23).
One of the major difficulties in the identification of Aeromonas
strains to species level concerns the current number of
recognized taxa (n 14) and the lack of clear-cut phenotypic
tables useful in distinguishing each of these groups from the
others (17). This problem has arisen because taxonomic studies
often report only selected biochemical characteristics on newly
described species and then compare these results to phenotypic
data from previously published studies on genetically
related taxa. Although the tests used may be the same in each
study, the growth conditions, medium composition, inoculation
procedure, and incubation conditions may vary considerably,
potentially affecting results (12, 15).
In some instances, commercial systems have been used to
generate the data, and it is not always clear how closely microidentification
test results parallel results obtained by conventional
methodology (2). Furthermore, many of the biochemical
schemes currently used in clinical laboratories to
identify aeromonads predate the description of newer taxa (1,
5, 7, 22). This fact calls into question whether previously selected
biochemical tests used to identify

Results (Thai) 1:

สมุดรายวันของจุลชีววิทยาคลินิก 2003 มิถุนายน p. 2348 – โคโยตี้ฉบับ 41 หมายเลข 6ดอย 0095-1137/03/$08.00 0: 10.1128/JCM.41.6.2348–2357.2003ลิขสิทธิ์ © 2003 สมาคมจุลชีววิทยาอเมริกัน สงวนลิขสิทธิ์Aeromonas สกุล: ลักษณะทางชีวเคมี ผิดปกติปฏิกิริยา และรูปแบบรหัสฟีโนไทป์Sharon L. แอ๊บ เวนดี้เคดับบลิวเจ และ J. Michael Janda *ห้องปฏิบัติการจุลินทรีย์โรค กองโรคติดต่อกรมควบคุม แคลิฟอร์เนียบริการสุขภาพ ริชมอนด์ แคลิฟอร์เนีย 94804ได้รับ 2 2002 ธันวาคม/ส่งคืนสำหรับการปรับเปลี่ยน 4 2003 กุมภาพันธ์/ยอมรับได้ 25 2546 กุมภาพันธ์ประเมินรวม 193 สายพันธุ์แทน genomospecies Aeromonas ต่าง ๆ 14 มีฟีโนไทป์ 63คุณสมบัติในการสร้างตารางมีประโยชน์สำหรับรหัสอ้างอิงของ mesophilic aeromonads เพียง 9 ของ 62ผลลัพธ์เหมือนกันผลการทดสอบทางชีวเคมี (14%) และพบว่าการหมักคาร์โบไฮเดรตบางสามารถเชื่อมโยงกับสายพันธุ์เฉพาะ จำนวนของคุณสมบัติที่ผิดปกติ หรือ aberrant สำหรับสกุล Aeromonas ก็ตรวจพบในการเก็บรวบรวมสายพันธุ์ 428 (193 ในการศึกษาฟีโนไทป์ 235 ในรีวิวย้อนหลัง) การทดสอบเหล่านี้รวมความอ่อนแอให้กับตัวแทน vibriostatic หมัก m-ทอและสาร D ไฮโตรไลซ์ของ urea และการขาดกิจกรรม cytochrome oxidase หมัก melibiose เชื่อมโยงกับ raffinose หมักทั้งหมดสายพันธุ์ Aeromonas ยกเว้น A. jandaei คีย์มีบริการสำหรับห้องปฏิบัติการทางคลินิกที่เลือกที่จะระบุ aeromonadsกับสายพันธุ์ ระดับขึ้น decarboxylase Møeller เริ่มต้นและ dihydrolase ปฏิกิริยา นอกจากนี้ระบุการทดสอบใหม่หลายที่ช่วยเพื่อแยกสมาชิก A. caviae ที่ซับซ้อน (A. caviae, A. สื่อและ A. eucreonophila)สกุล Aeromonas มีระดับจำนวนอนุกรมวิธานและการปรับปรุงระบบการตั้งชื่อ 15 ปีผ่านมา ถึงแม้ว่าเดิม อยู่ในครอบครัว Vibrionaceae (34), ซึ่งรวมปริมาณวิบริโอ Photobacterium และ Plesiomonasสืบสวนทางการระบุว่า การสกุล Aeromonas ไม่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ vibrios แต่แบบฟอร์ม monophyletic หน่วยในกลุ่มย่อย-3 ของชั้นProteobacteria (25, 31) ข้อสรุปเหล่านี้ necessitated การกำจัดของ Aeromonas จาก Vibrionaceae และโอนย้ายครอบครัวเพื่อครอบครัวใหม่ Aeromonadaceae (8) ในทำนองเดียวกัน ห้าสายพันธุ์ของ Aeromonas รู้จัก 15 ปี (21), 3ที่มีอยู่ (A. hydrophila, A. sobria และ A. caviae) เป็นphenospecies กล่าวคือ มีชื่อที่ประกอบด้วยหลายสายพันธุ์กลุ่มดีเอ็นเอ สมาชิกที่อาจไม่แตกต่างจากกันโดยลักษณะทางชีวเคมีที่ง่าย ในเวลาต่อมาตรวจสอบระบบทำให้หมายเลขของถูกต้องเผยแพร่ genomospecies ขึ้นที่ 14 (23), และเป็นคาดว่า จะอธิบายเพิ่มเติมสายพันธุ์เนื่องจากสายพันธุ์หายากได้รับการระบุที่อยู่ในสร้างสายพันธุ์ Aeromonasประกอบด้วยสกุล Aeromonas สำคัญมนุษย์เชื้อโรคก่อให้เกิดบริการหลัก และรองในภูมิคุ้มกันคน แผลติดเชื้อในคนสุขภาพดีและในผู้ป่วยที่ รับยาดูดพลังบำบัดและจำนวนน้อยดีอธิบายโรคเช่น peritonitisเยื่อหุ้มสมองอักเสบ และการติดเชื้อของตา ข้อต่อ และกระดูก (18)กระเพาะ ประกาศทางคลินิกทั่วไป ยังคงอยู่ขัดแย้ง (18) ในขณะที่มีจำนวน welldescribedกรณีที่เกี่ยวข้อง Aeromonas กระเพาะในการวรรณกรรม มันยังคงมาว่าแยกอุจจาระมากที่สุดหายจากอาการคนเป็นตัวแทน etiologicรับผิดชอบสำหรับอาการผล ทฤษฎีหนึ่งอธิบายความขัดแย้งคือส่วนย่อยที่เฉพาะเจาะจงของ Aeromonasทำให้เกิดโรคสำหรับมนุษย์และแผน biotyping ที่จำเป็นต้องพัฒนาเพื่อแยกความแตกต่างจากสายพันธุ์ทางการแพทย์สิ่งแวดล้อม(23)หนึ่งในปัญหาสำคัญในการระบุ Aeromonasสายพันธุ์สายพันธุ์ระดับเกี่ยวข้องกับจำนวนปัจจุบันรู้จักวงศ์ (n 14) และการขาด clear-cut ฟีโนไทป์ประโยชน์ในความแตกต่างของแต่ละกลุ่มเหล่านี้จากตารางอื่น ๆ (17) ปัญหานี้เกิดขึ้นเนื่องจากการศึกษาอนุกรมวิธานมักรายงานลักษณะทางชีวเคมีเพียงเลือกใหม่อธิบายชนิด และเปรียบเทียบผลลัพธ์เหล่านี้จะเป็นฟีโนไทป์ข้อมูลจากก่อนหน้านี้ เผยแพร่การศึกษาทางพันธุกรรมวงศ์ที่เกี่ยวข้อง แม้ว่าการทดสอบที่ใช้อาจจะเหมือนกันในแต่ละศึกษา เงื่อนไขการเติบโต องค์ประกอบกลาง กักบริเวณขั้นตอน และบ่มเงื่อนไขอาจแตกต่างกันมากอาจส่งผลกระทบต่อผลลัพธ์ (12, 15)ในบางกรณี ระบบในเชิงพาณิชย์มีการใช้สร้างข้อมูล และก็จะไม่ชัดเจนว่า microidentificationทดสอบผลผลแบบขนานได้รับ โดยทั่วไปวิธีการ (2) นอกจากนี้ หลายการทางชีวเคมีในปัจจุบันใช้ในห้องปฏิบัติการทางคลินิกเพื่อระบุคำอธิบายของใหม่ (1, predate aeromonads5, 7, 22) ความจริงข้อนี้เป็นคำถามเรียกว่าเลือกใช้เพื่อระบุการทดสอบทางชีวเคมี

Results (Thai) 2:

วารสารจุลชีววิทยาคลินิกมิถุนายน 2003 P 2348-2357 ฉบับ 41, ฉบับที่ 6
0095-1137 / 03 / 08.00 $ 0 ดอย: 10.1128 / JCM.41.6.2348-2357.2003
Copyright © 2003, สังคมอเมริกันสำหรับจุลชีววิทยา สงวนลิขสิทธิ์.
พืชสกุล Aeromonas: ชีวเคมี, ผิดปกติ
ปฏิกิริยาและฟีโนไทป์แบบแผนประจำตัว
ชารอนแอลแอ็บบอทเวนดี้ KW Cheung และไมเคิลเจ Janda *
จุลินทรีย์โรคทางห้องปฏิบัติการกองควบคุมโรคติดต่อแคลิฟอร์เนียกรม
บริการสุขภาพริชมอนด์ แคลิฟอร์เนีย 94804
ได้รับ 2 ธันวาคม 2002 / คืนสำหรับการปรับเปลี่ยน 4 กุมภาพันธ์ 2003 / ได้รับการยอมรับ 25 กุมภาพันธ์ 2003
รวม 193 สายพันธุ์ที่เป็นตัวแทนของ 14 genomospecies Aeromonas ที่แตกต่างกันได้รับการประเมิน 63 ฟีโนไทป์
คุณสมบัติในการสร้างตารางที่มีประโยชน์สำหรับการระบุการอ้างอิงของ aeromonads mesophilic เพียง 9 62
การทดสอบทางชีวเคมี (14%) ให้ผลเหมือนกันและหมักของคาร์โบไฮเดรตบางอย่างก็จะพบว่า
จะเชื่อมโยงกับสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจง จำนวนของคุณสมบัติที่ผิดปกติหรือผิดปกติสำหรับสกุล Aeromonas เอนอกจากนี้ยังมี
การตรวจพบในคอลเลกชันของสายพันธุ์ 428 (193 ในการศึกษาฟีโนไทป์ 235 ในการตรวจสอบย้อนหลัง) การทดสอบเหล่านี้
รวมถึงความไวต่อการเป็นตัวแทน vibriostatic หมักของ M-ทอและ D-ไซโลส, จองจำของยูเรียและ
ขาดการออกกำลัง oxidase cytochrome การหมัก melibiose เชื่อมโยงกับการหมัก raffinose ในทุก
สายพันธุ์เชื้อ Aeromonas ยกเว้น A. jandaei คีย์จะมีให้สำหรับการทดลองทางคลินิกเลือกที่จะระบุ aeromonads
ถึงระดับสายพันธุ์ขึ้นอยู่กับการเริ่มต้น decarboxylase Moeller และปฏิกิริยา dihydrolase นอกจากนี้
การทดสอบใหม่ ๆ ที่ถูกระบุความช่วยเหลือให้กับสมาชิกที่แยกต่างหากจากเอเชื้อ Aeromonas คอมเพล็กซ์ ( A. เชื้อ Aeromonas กสื่อที่
และ A. eucreonophila).
สกุลเชื้อ Aeromonas มีระดับจำนวนอนุกรมวิธาน
และศัพท์การแก้ไขที่ผ่านมา 15 ปี. แม้ว่า
วางไว้เดิมในครอบครัว Vibrionaceae (34) ซึ่ง
ยังรวมถึงสกุล Vibrio, Photobacterium และ Plesiomonas,
สืบสวนสายวิวัฒนาการตามมาชี้ให้เห็นว่า
สกุล Aeromonas ไม่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับวิบิโอ แต่
รูปแบบหน่วยไฟย์เลติใน -3 กลุ่มย่อยของ ระดับ
Proteobacteria (25 31) ข้อสรุปเหล่านี้จำเป็นต้องมีการกำจัด
ของเชื้อ Aeromonas จากครอบครัว Vibrionaceae และการถ่ายโอน
ไปยังครอบครัวใหม่ Aeromonadaceae (8) ในทำนองเดียวกันเพียงห้า
สายพันธุ์ของเชื้อ Aeromonas ได้รับการยอมรับ 15 ปีที่ผ่านมา (21) สาม
ที่ ( A. hydrophila, A. sobria และ A. เชื้อ Aeromonas) ดำรงอยู่
phenospecies, ที่อยู่, ที่ชื่อสปีชีส์ที่มีหลาย
กลุ่มดีเอ็นเอสมาชิก ซึ่งไม่สามารถจะแตกต่างไป
จากคนอื่นโดยลักษณะทางชีวเคมีที่เรียบง่าย ที่เกิดขึ้นภายหลัง
การตรวจสอบอย่างเป็นระบบมีผลในจำนวน
ของ genomospecies ตีพิมพ์ที่ถูกต้องเพิ่มขึ้นถึง 14 (23) และจะมีการ
คาดการณ์ไว้ว่าสายพันธุ์เพิ่มเติมจะอธิบายเพราะ
สายพันธุ์ที่หายากได้รับการระบุที่ไม่ได้อาศัยอยู่ในที่ใด ๆ
ที่จัดตั้งขึ้นสายพันธุ์เชื้อ Aeromonas.
สกุลเชื้อ Aeromonas ประกอบด้วยสิ่งสำคัญ เชื้อโรคที่มนุษย์
ก่อให้เกิดภาวะโลหิตเป็นพิษประถมศึกษาและมัธยมศึกษาในภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่อง
คนติดเชื้อแผลร้ายแรงในบุคคลที่มีสุขภาพดี
และในผู้ป่วยที่เข้ารับการรักษาด้วยปลิงยา
และจำนวนของการเจ็บป่วยน้อยกว่าการอธิบายอย่างดีเช่นเยื่อบุช่องท้อง,
เยื่อหุ้มสมองอักเสบและการติดเชื้อของดวงตาข้อต่อและกระดูก ( 18).
กระเพาะอาหารและลำไส้อาการทางคลินิกที่พบมากที่สุดยังคงเป็น
ที่ถกเถียงกัน (18) ในขณะที่มีจำนวนของ welldescribed
กรณีของกระเพาะและลำไส้อักเสบเชื้อ Aeromonas ที่เกี่ยวข้องใน
วรรณคดีก็ยังคงเป็นที่มาว่าอุจจาระในที่สุด
การกู้คืนจากบุคคลที่มีอาการเป็นตัวแทนสาเหตุ
ความรับผิดชอบสำหรับโรคอุจจาระร่วง ทฤษฎีหนึ่งที่จะอธิบาย
ความขัดแย้งนี้ก็คือว่าส่วนย่อยเฉพาะที่เฉพาะเจาะจงของเชื้อ Aeromonas เป็น
ต้นเหตุการเกิดโรคสำหรับมนุษย์และรูปแบบการพิมพ์ไบโอจะต้องมี
การพัฒนาเพื่อแยกความแตกต่างด้านสิ่งแวดล้อมจากสายพันธุ์ที่ทางคลินิก
(23).
หนึ่งในปัญหาสำคัญในตัวของเชื้อ Aeromonas
สายพันธุ์ความกังวลระดับสปีชีส์ หมายเลขปัจจุบันของ
แท็กซ่าได้รับการยอมรับ (n 14) และการขาดความชัดเจนฟีโนไทป์ตัด
ตารางประโยชน์ในการแยกความแตกต่างแต่ละกลุ่มเหล่านี้จาก
คนอื่น ๆ (17) ปัญหานี้เกิดขึ้นเพราะการศึกษาอนุกรมวิธาน
มักจะรายงานเลือกเฉพาะลักษณะทางชีวเคมีในใหม่
สายพันธุ์อธิบายแล้วเปรียบเทียบผลลัพธ์เหล่านี้เพื่อฟีโนไทป์
ข้อมูลจากการศึกษาที่ตีพิมพ์ก่อนหน้านี้ในพันธุกรรม
แท็กซ่าที่เกี่ยวข้อง ถึงแม้ว่าการทดสอบที่ใช้อาจจะเหมือนกันในแต่ละ
การศึกษาสภาพการเจริญเติบโตขององค์ประกอบกลางฉีดวัคซีน
วิธีการและเงื่อนไขการบ่มอาจแตกต่างกันมาก
อาจส่งผลกระทบต่อผลการ (12, 15).
ในบางกรณีระบบเชิงพาณิชย์ได้ใช้ในการ
สร้าง ข้อมูลและก็ไม่เคยชัดเจนว่าใกล้ชิด microidentification
ผลการทดสอบผลแบบขนานได้รับโดยทั่วไป
วิธีการ (2) นอกจากนี้หลายทางชีวเคมี
รูปแบบที่ใช้ในปัจจุบันในห้องปฏิบัติการทางคลินิกเพื่อ
แจ้ง aeromonads ก่อนวันจริงรายละเอียดของแท็กซ่ารุ่นใหม่ (1,
5, 7, 22) ความจริงเรื่องนี้เรียกว่าเป็นคำถามที่เลือกไว้ก่อนหน้า
การทดสอบทางชีวเคมีที่ใช้ในการระบุ