Genetical genomics is a strategy fo

Genetical genomics is a strategy for mapping gene expression variation to expression quantitative trait loci (eQTLs). We
performed a genetical genomics experiment in four functionally distinct but developmentally closely related hematopoietic
cell populations isolated from the BXD panel of recombinant inbred mouse strains. This analysis allowed us to analyze eQTL
robustness/sensitivity across different cellular differentiation states. Although we identified a large number (365) of ‘‘static’’
eQTLs that were consistently active in all four cell types, we found a much larger number (1,283) of ‘‘dynamic’’ eQTLs
showing cell-type–dependence. Of these, 140, 45, 531, and 295 were preferentially active in stem, progenitor, erythroid, and
myeloid cells, respectively. A detailed investigation of those dynamic eQTLs showed that in many cases the eQTL specificity
was associated with expression changes in the target gene. We found no evidence for target genes that were regulated by
distinct eQTLs in different cell types, suggesting that large-scale changes within functional regulatory networks are
uncommon. Our results demonstrate that heritable differences in gene expression are highly sensitive to the developmental
stage of the cell population under study. Therefore, future genetical genomics studies should aim at studying multiple welldefined
and highly purified cell types in order to construct as comprehensive a picture of the changing functional
regulatory relationships as possible.

Results (Thai) 1:

Genetical genomics เป็นกลยุทธ์สำหรับเปลี่ยนแปลงนิพจน์ยีนแม็ปการนิพจน์เชิงปริมาณติด loci (eQTLs) เราดำเนินการ genetical genomics ทดลองในสี่ฟังก์ชันที่แตกต่างกันแต่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด developmentally กำเนิดของเม็ดเลือดประชากรเซลล์ที่แยกต่างหากจากแผง BXD ของ recombinant inbred เมาส์สายพันธุ์ การวิเคราะห์นี้ทำให้เราวิเคราะห์ eQTLเสถียรภาพ/ไวทั่วอเมริกาสร้างความแตกต่างของเซลล์แตกต่างกัน ถึงแม้ว่าเราระบุจำนวน (365) ''คง ''eQTLs ที่ถูกใช้งานอย่างสม่ำเสมอในทุกเซลล์สี่ เราพบมากจำนวน (1,283) ของ eQTLs ''ไดนามิก ''แสดงเซลล์ชนิด – พึ่งพา เหล่านี้ 140, 45, 531, 295 นำโน้ตงานก้าน progenitor, erythroid และชนิดไมอิลอยด์เซลล์ ตามลำดับ ตรวจสอบรายละเอียดของ eQTLs แบบไดนามิกที่ชี้ให้เห็นว่าในหลายกรณี eQTL specificityเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงนิพจน์ในยีนเป้าหมาย เราพบหลักฐานไม่สำหรับยีนเป้าหมายที่ถูกกำหนดโดยeQTLs แตกต่างกันในเซลล์ต่างชนิด แนะนำการเปลี่ยนแปลงขนาดใหญ่ภายในเครือข่ายกำกับดูแลงานใช่ ผลของเราแสดงให้เห็นว่า heritable ความแตกต่างของยีนมีความไวสูงเพื่อการพัฒนาขั้นตอนประชากรเซลล์ภายใต้การศึกษา ดังนั้น genetical genomics ในอนาคตการศึกษาควรมุ่งศึกษา welldefined หลายและเซลล์บริสุทธิ์สูงชนิดเพื่อสร้างภาพเป็นครอบคลุมของการเปลี่ยนแปลงทำงานความสัมพันธ์ที่กำกับดูแลเป็นไปได้

Results (Thai) 3:

พันธุศาสตร์พันธุกรรมเป็นกลยุทธ์สำหรับการทำแผนที่ยีนลักษณะปริมาณการเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของ ( eqtls ) เราได้ทำการทดลองในพันธุศาสตร์
สี่หน้าที่แตกต่างกันแต่เกี่ยวข้องกันอย่างใกล้ชิดกับพัฒนาการของเซลล์เม็ดโลหิต
ประชากรแยกจาก bxd แผง recombinant เมาส์สายพันธุ์สายพันธุ์ การวิเคราะห์นี้จะอนุญาตให้เราวิเคราะห์ eqtl
ความไวในสหรัฐอเมริกา / การเปลี่ยนสภาพของเซลล์ต่าง ๆ ถึงแม้ว่าเราจะระบุตัวเลขขนาดใหญ่ ( 365 ) ' 'static ' '
eqtls ที่เสมออยู่ในทั้งสี่ชนิดของเซลล์ที่เราพบเป็นจำนวนขนาดใหญ่มาก ( 1217 ) ' ' ' 'dynamic eqtls
แสดงชนิดเซลล์และการพึ่งพา ของเหล่านี้ , 140 , 45 , 531 , 295 กำลังอยู่ preferentially ในลำต้นให้เป็น erythroid , และ
ชนิดเซลล์ตามลำดับ ตรวจสอบรายละเอียดของแบบไดนามิก eqtls พบว่าในหลายกรณี eqtl ความจำ
ได้เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกของยีนเป้าหมาย เราไม่พบหลักฐานที่ถูกควบคุมโดยยีนเป้าหมายที่แตกต่างกันในเซลล์ต่าง ๆ
eqtls บอกว่าการเปลี่ยนแปลงขนาดใหญ่ภายในเครือข่ายองค์กรแบบ
พิสดารผลของเราแสดงให้เห็นว่า ความแตกต่างสามารถในการแสดงออกของยีนที่มีความไวสูงเพื่อพัฒนาการ
เวทีของเซลล์ประชากรศึกษา ดังนั้นในอนาคตควรมีการศึกษาพันธุกรรมพันธุศาสตร์มุ่งเรียนหลาย welldefined
บริสุทธิ์สูงและชนิดของเซลล์ในการสร้างเป็นครอบคลุมภาพของเปลี่ยนการทำงาน
กำกับดูแลความสัมพันธ์ที่เป็นไปได้