2.3. Identification of the selected thermotolerant yeast strain
The selected yeast strain was morphologically, physiologically
and biochemically characterized by standard
methods described by Yarrow (1998). Assimilation of
nitrogen compounds was examined on solid media with
starved inocula following the method of Nakase and
Suzuki (1986). Growth at various temperatures was determined
by cultivation on YM agar and in YM broth using
an incubator and a water bath, respectively.
Identification and phylogenetic analysis of the yeast
strain based on comparative analysis of the sequence of
the D1/D2 domain of the large-subunit (LSU) rDNA
was carried out. The sequencing of the D1/D2 domain of
the LSU rDNA was carried out from PCR products of
genomic DNA fragments that were extracted from yeast
cells by the method of Lachance et al. (1999) with slight
modifications. The D1/D2 domain of the LSU rDNA
was amplified by PCR with forward primer NL-1 and
reverse primer NL-4 (O’Donnell, 1993). The PCR product
was checked by agarose gel electrophoresis, purified using
QIA Quick Purification Kit (Qiagen, Ontario, USA) and
cycle-sequenced using the ABI BigDye Terminator Cycle
Sequencing Kit Version. 3.1 (Applied Biosystems, California,
USA) with the external primers NL-1 and NL-4
(Kurtzman and Robnett, 1998). The sequences were determined
with an ABI PRISM 3100 automated DNA sequencer
(Applied Biosystems, California, USA) according to the
instructions of the manufacturer. The sequences were compared
pairwise using the BLAST homology search (Altschul
et al., 1990).
Results (
Thai) 2:
[Copy]Copied!
2.3 บัตรประจำตัวของยีสต์ทนร้อนที่เลือกสายพันธุ์
สายพันธุ์ยีสต์ที่เลือกเป็นสัณฐาน, สรีรวิทยา
และชีวเคมีโดดเด่นด้วยมาตรฐาน
วิธีการอธิบายโดยยาร์โรว์ (1998) การดูดซึมของ
สารประกอบไนโตรเจนถูกตรวจสอบในสื่อที่มั่นคงกับ
inocula Starved ต่อไปนี้วิธีการ Nakase และ
ซูซูกิ (1986) การเจริญเติบโตที่อุณหภูมิต่างๆถูกกำหนด
โดยการเพาะปลูกใน YM วุ้นและน้ำซุป YM ใช้
ศูนย์บ่มเพาะและอ่างน้ำตามลำดับ.
กำหนดและวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของยีสต์
สายพันธุ์ขึ้นอยู่กับการวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับของ
โดเมน D1 / D2 ของขนาดใหญ่ subunit (LSU) rDNA
ได้ดำเนินการ ลำดับของโดเมน D1 / D2 ของ
LSU rDNA ถูกหามออกจากผลิตภัณฑ์ PCR ของ
จีโนมดีเอ็นเอที่ถูกสกัดจากยีสต์
เซลล์โดยวิธี Lachance et al, (1999) ที่มีเล็กน้อย
การปรับเปลี่ยน โดเมน D1 / D2 ของ LSU rDNA
ถูกขยายโดยวิธี PCR กับไพรเมอร์ไปข้างหน้า NL-1 และ
ย้อนกลับไพรเมอร์ NL-4 (ดอนเนลล์ 1993) ผลิตภัณฑ์ PCR
ได้รับการตรวจสอบโดยข่าวคราว agarose บริสุทธิ์โดยใช้
QIA Kit บริสุทธิ์อย่างรวดเร็ว (Qiagen, Ontario, USA) และ
วงจรติดใจใช้ ABI BigDye Terminator วงจร
ลำดับ Kit รุ่น 3.1 (Applied Biosystems, California,
USA) กับไพรเมอร์ภายนอก NL-1 และ NL-4
(เคิร์ทซ์และ Robnett, 1998) ลำดับการได้รับการพิจารณา
กับ ABI PRISM 3100 ซีเควนดีเอ็นเออัตโนมัติ
(Applied Biosystems, California, USA) ตาม
คำแนะนำของผู้ผลิต ลำดับที่ได้มาเปรียบเทียบ
คู่โดยใช้การค้นหาระเบิดที่คล้ายคลึงกันนี้ (Altschul
et al., 1990)
Being translated, please wait..
