Randomly amplified polymorphic DNA(

Randomly amplified polymorphic DNA
(RAPD) is a molecular technique using a
PCR-based method, which does not require
previous sequence information of the
genome to be studied. In a RAPD assay, a
short, usually ten nucleotides long, arbitrary
primer is used, which generally anneals with
multiple sites in different regions of the
genome and amplifies several genetic loci
simultaneously. This technique is simple,
relatively inexpensive and has been employed
to analyze the intra-and intergeneric [9-10]
genetic diversity of plants including
species and variety identification. The RAPD
technique can detect DNA segments present
in individual samples to infer genetic
relationships between different samples.
A serious shortcoming of RAPD is, however,
inconsistency of banding patterns due to
high sensitivity to reaction conditions [11].
To mitigate this problem, high-annealingtemperature RAPD (HAT-RAPD) technique
has been developed to provide more
reproducibility by increasing the temperature
for the primer annealing step above 46°C
instead of 35-38°C in RAPD reactions [9].
This form of genomic analysis allows a
random sampling of the complete genome
to provide information about phenotypic
traits of interest. The phylogenetic diversity
referring to relatedness among plant samples
have been noted by scoring the presence or
absence of HAT-RAPD polymorphic bands
in the amplified products and construction
of dendrograms by measure of genomic
polymorphism. Dendrograms generated
from the analysis were compared with
known background data for each plant
samples. HAT-RAPD has successfully been
utilized to study genetic diversity of plants
and DNA patterns of interest for instance,
Musa [10], Litchi chinensis, Dimocarpus longan,
Peuraria [11], Curcuma [12], basil cultivars [13],
and Ficus [14]. Furthermore, the presence or
absence of an amplified band can be used as
a distinguishing unique character of that
species or clade of species. Then sequence
characterized amplified region (SCAR)
markers [15] can be developed to produce
reliable unique PCR-based results from
the polymorphic HAT-RAPD markers.
The SCAR marker method is similar to the
RAPD method but uses longer primers
(18-24 bases) to increase the specificity of
the primers. The results are less sensitive to
changes in reaction conditions and are
significantly more reproducible. SCAR
marker has successfully been utilized
to characterize a variety of plant specific phenotypes referring to the characteristic
band from gel-electrophoresis result [15].
Such a methodology has been successfully
demonstrated in a characterization of several
plants in many areas such as agriculture and
taxonomy in Curcuma [12] Ficus [14] lychee
cultivars [16] longan cultivars [17] and Thai
fragrant rice mutants [18]. In addition, this
method has been used for detection of
papaya seed adulteration in traded black
pepper powder [19] and discrimination of
Artemisia herbs from other dried leaves as
medicinal material in traditional Korean
medicine markets [20]

Results (Vietnamese) 1:

Ngẫu nhiên amplified polymorphic DNA(RAPD) là một kỹ thuật phân tử bằng cách sử dụng mộtĐảng Cộng sản Romania, dựa trên phương pháp, mà không yêu cầutrước thông tin trình tự của cácgen để được nghiên cứu. Trong một khảo nghiệm RAPD, mộtngắn hạn, thường là mười nucleotide lâu dài, tùy ýmồi được sử dụng, mà nói chung anneals vớinhiều trang web trong các khu vực khác nhau của cácbộ gen và khuếch đại một số gen locicùng một lúc. Kỹ thuật này là đơn giản,tương đối rẻ và đã được làm việcđể phân tích nội- và intergeneric [9-10]sự đa dạng di truyền vật bao gồm cảxác định loài và đa dạng. RAPDkỹ thuật có thể phát hiện ADN phân đoạn hiện naytrong mẫu cá nhân để suy ra di truyềnmối quan hệ giữa các mẫu khác nhau.Một thiếu sót nghiêm trọng của RAPD là, Tuy nhiên,mâu thuẫn của dải mẫu dođộ nhạy cao với điều kiện phản ứng [11].Để giảm thiểu vấn đề này, Trung-annealingtemperature RAPD (HAT – RAPD) kỹ thuậtđã được phát triển để cung cấp nhiều hơn nữareproducibility bằng cách tăng nhiệt độcho tôi bước mồi trên 46° Cthay vì 35-38 ° C trong các phản ứng RAPD [9].Hình thức này của gen phân tích cho phép mộtLấy mẫu ngẫu nhiên của gen hoàn chỉnhcung cấp thông tin về kiểu hìnhđặc điểm của quan tâm. Phát sinh loài đa dạngđề cập đến relatedness trong số các mẫu thực vậtđã được ghi nhận bởi ghi sự hiện diện haytrường hợp không có bands polymorphic HAT – RAPDkhuếch đại các sản phẩm và xây dựngcủa dendrograms bằng các biện pháp của genđa hình. Dendrograms tạo ratừ những phân tích được so sánh vớiđược biết đến nền tảng dữ liệu cho mỗi nhà máymẫu. HAT – RAPD đã thành côngsử dụng để nghiên cứu sự đa dạng di truyền thực vậtvà các mẫu DNA của lãi suất ví dụ,Musa [10], vải chinensis, Dimocarpus longan,Peuraria [11], Curcuma [12], giống cây trồng húng quế [13],và Ficus [14]. Hơn nữa, sự hiện diện haysự vắng mặt của một ban nhạc khuếch đại có thể được sử dụng nhưmột nhân vật duy nhất để phân biệt đóloài hoặc nhánh của loài. Sau đó, Chuỗiđặc trưng ở miền khuếch đại (SẸO)dấu [15] có thể được phát triển để sản xuấtđáng tin cậy duy nhất Đảng Cộng sản Romania, dựa trên kết quả từđánh dấu mũ – RAPD bướu.Phương pháp đánh dấu vết SẸO là tương tự như cácPhương pháp RAPD nhưng sử dụng lớp lót dài(căn cứ 18-24) để tăng các đặc trưng củalớp lót. Kết quả là ít nhạy cảm vớinhững thay đổi trong điều kiện phản ứng vàđáng kể hơn thể sanh sản nhiều. VẾT SẸOđánh dấu thành công được sử dụngvới đặc trưng một loạt các nhà máy cụ thể phenotypes đề cập đến đặc tínhBan nhạc đến từ gel electrophoresis quả [15].Một phương pháp đã thành côngchứng minh trong một đặc tính của một sốnhà máy ở nhiều lĩnh vực như nông nghiệp vàphân loại trong vải Ficus Curcuma [12] [14]giống cây trồng longan giống cây trồng [16] [17] và Thái Langạo thơm đột [18]. Ngoài ra, điều nàyphương pháp đã được sử dụng để phát hiệnđu đủ hạt adulteration được giao dịch màu đenhạt tiêu bột [19] và phân biệt đối xử củaArtemisia loại thảo mộc từ lá khô khác nhưtài liệu y học truyền thống Hàn Quốcthị trường dược phẩm [20]

Results (Vietnamese) 2:

DNA đa hình ngẫu nhiên khuếch đại
(RAPD) là một kỹ thuật phân tử sử dụng một
phương pháp PCR-based, mà không yêu cầu
thông tin trình tự trước đó của
bộ gen được nghiên cứu. Trong một thử nghiệm RAPD, một
ngắn, dài thường mười nucleotide, tùy ý
mồi được sử dụng, mà thường anneals với
nhiều trang web ở các vùng khác nhau của
bộ gen và khuếch đại nhiều locus gen
cùng một lúc. Kỹ thuật này rất đơn giản,
tương đối rẻ tiền và đã được sử dụng
để phân tích các nội và intergeneric [9-10]
đa dạng di truyền của cây bao gồm
các loài và xác định nhiều. Các RAPD
kỹ thuật có thể phát hiện phân đoạn DNA hiện diện
trong từng mẫu, suy ra gen
mối quan hệ giữa các mẫu khác nhau.
Một thiếu sót nghiêm trọng của RAPD là, tuy nhiên,
không thống nhất của mô hình dải do
sự nhạy cảm cao với các điều kiện phản ứng [11].
Để giảm thiểu vấn đề này, cao annealingtemperature RAPD (HAT-RAPD) kỹ thuật
đã được phát triển để cung cấp thêm
khả năng tái lặp bằng cách tăng nhiệt độ
cho bước mồi ủ trên 46 ° C
thay vì 35-38 ° C trong phản ứng RAPD [9].
Đây là hình thức phân tích gen cho phép một
ngẫu nhiên lấy mẫu của bộ gen hoàn chỉnh
để cung cấp thông tin về kiểu hình
đặc điểm quan tâm. Sự đa dạng sinh loài
cập đến Quan hệ giữa các mẫu thực vật
đã được ghi nhận bằng cách ghi sự có mặt hay
vắng mặt của các ban nhạc đa hình HAT-RAPD
trong các sản phẩm khuếch đại và xây dựng
của dendrograms bằng biện pháp gen
đa hình. Dendrograms tạo ra
từ việc phân tích được so sánh với
dữ liệu nền được biết đến cho mỗi nhà máy
mẫu. HAT-RAPD đã thành công được
sử dụng để nghiên cứu sự đa dạng di truyền của các nhà máy
và các mẫu DNA quan tâm ví dụ,
Musa [10], Vải chinensis, Dimocarpus longan,
Peuraria [11], Curcuma [12], cây húng quế [13],
và Ficus [14]. Hơn nữa, sự hiện diện hay
vắng mặt của một ban nhạc khuếch đại có thể được sử dụng như là
một nhân vật độc đáo khác biệt của rằng
loài hoặc nhánh của loài. Sau đó, trình tự
khu vực đặc trưng khuếch đại (SCAR)
đánh dấu [15] có thể được phát triển để tạo ra
kết quả PCR dựa trên duy nhất đáng tin cậy từ
các dấu HAT-RAPD đa hình.
Phương pháp SCAR đánh dấu tương tự như
phương pháp RAPD nhưng sử dụng mồi còn
(18-24 căn cứ ) để tăng tính đặc hiệu của
mồi. Kết quả là ít nhạy cảm với
những thay đổi trong điều kiện phản ứng và
tái sản xuất nhiều hơn đáng kể. SCAR
dấu đã thành công được sử dụng
để mô tả một loạt các kiểu hình cụ thể nhà máy đề cập đến các đặc điểm
ban nhạc từ kết quả gel điện di [15].
Một phương pháp như vậy đã thành công
chứng minh trong một đặc tính của một số
nhà máy trong nhiều lĩnh vực như nông nghiệp và
phân loại trong Curcuma [12] Ficus [14] vải
giống [16] nhãn giống [17] và Thái
đột biến gạo thơm [18]. Ngoài ra, điều này
phương pháp đã được sử dụng để phát hiện
sự pha trộn hạt đu đủ trong giao dịch đen
bột hạt tiêu [19] và phân biệt đối xử của
các loại thảo mộc Artemisia từ lá khô khác như
dược liệu trong truyền thống Hàn Quốc
thị trường y học [20]