Accurate species determination of p

Accurate species determination of plant pathogens is a prerequisite for their control and quarantine, and further for assessing their potential threat to crops. The family Peronosporaceae (Straminipila; Oomycota) consists of obligate biotrophic pathogens that cause downy mildew disease on angiosperms, including a large number of cultivated plants. In the largest downy mildew genus Peronospora, a phylogenetically complex clade includes the economically important downy mildew pathogens of spinach and beet, as well as the type species of the genus Peronospora. To resolve this complex clade at the species level and to infer evolutionary relationships among them, we used multi-locus phylogenetic analysis and species tree estimation. Both approaches discriminated all nine currently accepted species and revealed four previously unrecognized lineages, which are specific to a host genus or species. This is in line with a narrow species concept, i.e. that a downy mildew species is associated with only a particular host plant genus or species. Instead of applying the dubious name Peronospora farinosa, which has been proposed for formal rejection, our results provide strong evidence that Peronospora schachtii is an independent species from lineages on Atriplex and apparently occurs exclusively on Beta vulgaris. The members of the clade investigated, the Peronospora rumicis clade, associate with three different host plant families, Amaranthaceae, Caryophyllaceae, and Polygonaceae, suggesting that they may have speciated following at least two recent inter-family host shifts, rather than contemporary cospeciation with the host plants.

Results (Thai) 1:

พันธุ์ถูกต้องโรคพืชเป็นข้อกำหนดเบื้องต้นสำหรับการควบคุมและตรวจสอบ และการเพิ่มเติมสำหรับการประเมินภัยคุกคามศักยภาพของพืช ครอบครัว (Straminipila; Peronosporaceae Oomycota) ประกอบด้วย obligate biotrophic โรคที่ทำให้เกิดโรค downy คราบบน angiosperms รวมถึงพืชที่ปลูกเป็นจำนวนมาก ในสุดคราบ downy สกุล Peronospora, clade phylogenetically ซับซ้อนมีโรคคราบ downy สำคัญอย่างผักโขม และผักชนิดหนึ่ง และชนิดสายพันธุ์ของพืชสกุล Peronospora แก้ไข clade นี้ซับซ้อนระดับชนิด และเข้าใจความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการในหมู่พวกเขา เราใช้หลายโลกัสโพล phylogenetic วิเคราะห์ และประเมินแผนภูมิพันธุ์ ทั้งสองวิธี discriminated พันธุ์ยอมรับขณะนี้เก้าทั้งหมด และเปิดเผยเชื้อชาติไม่รู้จักก่อนหน้านี้สี่ ซึ่งเฉพาะโฮสต์สกุลหรือสปีชีส์ อยู่ในบรรทัดที่มีชนิดแคบแนวคิด เช่นว่า downy คราบชนิดเกี่ยวข้องกับการโฮสต์เฉพาะพืชสกุลหรือสปีชีส์ แทนที่จะใช้ชื่อสงสัย Peronospora farinosa ซึ่งมีการนำเสนอการปฏิเสธอย่างเป็นทางการ ผลของเราให้ฐานว่า Peronospora schachtii เป็นพันธุ์เป็นอิสระจากเชื้อชาติบน Atriplex และเห็นได้ชัดว่าเกิดขึ้นในรุ่น Beta vulgaris สมาชิกของ clade สอบสวน Peronospora rumicis clade เชื่อมโยงครอบครัวสามโฮสต์พืช Amaranthaceae, Caryophyllaceae และ Polygonaceae แนะนำที่ อาจมีต่อโฮสต์แฟมิลี่ระหว่างล่าน้อยสอง speciated กะ แทน cospeciation ที่ร่วมสมัยกับพืชโฮสต์

Results (Thai) 2:

การกำหนดสายพันธุ์ที่ถูกต้องของเชื้อสาเหตุโรคพืชเป็นสิ่งที่จำเป็นสำหรับการควบคุมและกักกันของพวกเขาและต่อไปสำหรับการประเมินภัยคุกคามที่อาจเกิดขึ้นของพวกเขาให้กับพืช ครอบครัว Peronosporaceae (Straminipila; Oomycota) ประกอบด้วยเชื้อโรค biotrophic หนี้บุญคุณที่ทำให้เกิดโรคราน้ำค้างใน Angiosperms รวมทั้งเป็นจำนวนมากของพืชที่ปลูก ในโรคราน้ำค้างสกุลที่ใหญ่ที่สุด Peronospora เป็น clade ซับซ้อน phylogenetically รวมถึงเศรษฐกิจที่สำคัญเชื้อโรคโรคราน้ำค้างของผักโขมและผักชนิดหนึ่งเช่นเดียวกับชนิดพันธุ์ของพืชและสัตว์ Peronospora เมื่อต้องการแก้ไข clade ที่ซับซ้อนนี้ที่ระดับสายพันธุ์และเพื่อสรุปความสัมพันธ์วิวัฒนาการในหมู่พวกเขาที่เราใช้ในหลายสถานที่การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการและการประมาณค่าชนิดต้นไม้ วิธีการทั้งสองเลือกปฏิบัติทั้งเก้าชนิดที่ได้รับการยอมรับในขณะนี้และเปิดเผยสี่ lineages ที่ไม่รู้จักก่อนหน้านี้ซึ่งระบุถึงประเภทหรือชนิดของโฮสต์ ซึ่งสอดคล้องกับแนวความคิดแคบ ๆ สายพันธุ์คือว่าเป็นสายพันธุ์โรคราน้ำค้างมีความเกี่ยวข้องกับเฉพาะประเภทพืชโดยเฉพาะหรือสปีชีส์ แทนการใช้ชื่อที่น่าสงสัย Peronospora farinosa ซึ่งได้รับการเสนอให้การปฏิเสธอย่างเป็นทางการผลของเราให้มีหลักฐานที่แข็งแกร่งที่ Peronospora schachtii เป็นสายพันธุ์ที่เป็นอิสระจาก lineages ใน Atriplex และเห็นได้ชัดว่าเกิดขึ้นเฉพาะใน Beta vulgaris สมาชิกของ clade ตรวจสอบที่ Peronospora rumicis clade ร่วมกับสามโฮสต์ครอบครัวพืชที่แตกต่างกัน Amaranthaceae, Caryophyllaceae และ Polygonaceae บอกว่าพวกเขาอาจจะ speciated ต่อไปนี้อย่างน้อยสองกะเจ้าภาพระหว่างครอบครัวที่ผ่านมามากกว่า cospeciation ร่วมสมัยกับ พืช

Results (Thai) 3:

การกำหนดชนิดของเชื้อโรคพืชที่ถูกต้องเป็นสิ่งจำเป็นเพื่อควบคุมและกักกันและเพิ่มเติมสำหรับการประเมินภัยคุกคามที่อาจเกิดขึ้นกับพืช peronosporaceae ครอบครัว ( straminipila ; โ ายโคตา ) ประกอบด้วย biotrophic หรือเชื้อโรคที่ก่อให้เกิดโรคราน้ำค้างในพืชดอก ได้แก่ ตัวเลขขนาดใหญ่ของการปลูกพืช ที่ใหญ่ที่สุดใน peronospora downy mildew สกุล ,เป็น phylogenetically clade ซับซ้อนรวมถึงความสําคัญทางเศรษฐกิจ downy mildew เชื้อโรคของผักโขม และผักชนิดหนึ่งที่เป็นประเภท ชนิด ของ สกุล peronospora . เพื่อแก้ไขปัญหานี้ซับซ้อนชนิด clade ในระดับและการอนุมานความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของพวกเขา เราใช้ความเชื่อและการประมาณค่าการวิเคราะห์ phylogenetic ต้นไม้หลายชนิดทั้งสองวิธีเลือกทั้งหมดเก้าในขณะนี้ยอมรับชนิดและพบสี่ที่ไม่รู้จักก่อนหน้านี้พันธุ์ซึ่งเป็นเฉพาะโฮสต์ประเภทชนิดหรือ นี้จะสอดคล้องกับแนวคิดชนิดแคบ เช่นว่า เชื้อราชนิดขนอ่อน เกี่ยวข้องกับ เพียงเฉพาะโฮสต์ชนิดหรือสกุลพืช . แทนการใช้ชื่อ peronospora farinosa พิรุธ ,ซึ่งได้รับการเสนออย่างเป็นทางการ ผลให้หลักฐานที่ peronospora schachtii เป็นอิสระสายพันธุ์จากพันธุ์ที่ atriplex และเห็นได้ชัดว่าเกิดขึ้นเฉพาะใน Beta vulgaris . สมาชิกของ clade ) , peronospora rumicis clade เชื่อมโยงกับที่แตกต่างกันสาม จัดเป็นพืชตระกูล มาแรนทาชี caryophyllaceae polygonaceae , และ ,ชี้ให้เห็นว่าพวกเขาอาจจะ speciated ต่อไปนี้อย่างน้อยสองล่าสุด อินเตอร์ กะ ครอบครัว มากกว่า cospeciation ร่วมสมัยกับโฮสต์พืช